Arama motorlarının biyolojiye özel versiyonlarının bulunması işlevsel olabilir. Böyle çok eski özel arama sunucuları hatırlıyorum ama Google varken kimsenin umursayacağı türden sonuçlar çıkaramıyorlardı.

Bu dönem ödevlerimi hazırlarken yardımcı olsun diye Google Özel Arama hizmetinden faydalanıp biyolojiye özel bir tane oluşturdum. Sonuçları taciz eden normalde biyoloji ile alakasız sayfaları da karşıma çıktıkça elemeye başladım. Bunun yanında zaten Google benim belirlediğim kelimelere göre biyolojiye özgü olduğunu düşündüğü siteleri daha önemli var sayarak arama sonuçlarını ek olarak iyileştiriyor.

Bahsettiğim arama motorunun bir yansısını da biyoloji.org ana sayfasına koydum. Mükemmel çalıştığını söyleyemem. Bana kalırsa şimdilik genel amaçlı Google’dan sadece %10 kadar daha iyi. Pek çok sorguda hiç fark olmuyor bile.

Gereksizleri elemenin yanında ansiklopedik değeri olan sayfaları da vurgulatmayı planlıyorum. Ama bu özelliği çok kullanacağımı sanmıyorum. Hangi adreslerin vurgulandığını arama motorunun gerçek ana sayfasından görebilirsiniz.

Rafineleme özelliği sayesinde belirli branşlara özel vurgulama yapmak ya da anahtar kelimeye göre iyileştirme yapmak mümkün olduğundan biraz daha vakit geçerse güzel sonuçlar çıkabileceğini düşünüyorum. Aslında pek çok kimse kendi ilgilendiği alt dallarda böyle arama özel arama hizmetlerini güçledirmek için sadece sonuçlarda gördüğü saçmalıkları temizlemek için saniyelerini verse sanki daha temiz bir internetimiz olur gibi geliyor bana.

Her ne kadar bu arama motoru Google tabanlı bir servisse bile, son zamanlarda değerini yeniden keşfettiğim Yahoo! Search‘e de arada bir şans vermenizi tavsiye ederim. Bazen şaşırtıcı çözümler sunuyor.

sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi

Denatüre jel elektroforezi dendiğini de duyabilirsiniz. SDS (sodium dodecyl sulfate) dediğimiz köpüklenmenin şahı kimyasal sayesinde gerçekleşiyor denatürasyon ki bu da bu çeşit elektroforezin en belirgin özelliği.

Artık nihayet öğrendim. Temmuz ayının iki haftası az uğraşmadım. Akşam saat sekiz dokuzlara kadar beklediğim oldu ama artık camdan jel sıyırmak korkulacak değil eğlenilecek bir hal aldı. Gerçekten de ufacık bir hatanın saatlerin emeğini yok etmeye sebep olacağı an, jelin kıvamını doğru tuturabilmişseniz dışardan izleyen birinin tahmin edemeyeceği bir haz yaşatıyor.

Ben proteinleri yürütüp fark var mı diye baktım sadece? Bir gün blotlama falan da yaparım inşallah. O da en çok merak ettiğim bir kaç konudan biri. Gelecek dönem (nihayet) açılacak olan Moleküler Biyoloji Laboratuvarı dersinin ilk öğrecilerinden olarak her şeyi ağırdan alan bölümüme olan kızgınlığımı belki biraz olsun geçirebilirim diye umut ediyorum. Moleküler Biyoloji değil de Biyoloji bölümünde okuduğumdan SDS-PAGE öğrenmek benim için önemli bir iş oluyor ne yazık ki. Ama kimseye fazla kızamıyorsun, herkes kendine göre haklı.

Bu arada elimdeki deney notlarını da değerlendirerek hiç bilmeyen birine yardımcı olacak bir belge taslağı hazırladım. Henüz kağıt üstünde ama biyoloji.org‘un belge arayüzüne yetişecek temiz bir sonuç çıkarmayı planlıyorum.

Nihayet :)

Duyurmanın vakti geldi dedik. Bu günü seçmiştik. Çok kötü bir tercih değil sanırım.

Biyoloji.org için sadece 2008 içinde yapılan ve terk edilen plan sayısı bile pek çok kimsenin tahmininden daha fazla. Gerçek sayısını ben de bilmiyorum aslında.

Şuan tematik bir ekşi sözlük klonu olduğunu söyleyebiliriz. Eğer WebFaction daha fazla bellek işgal etmemize müsaade etseydi daha güzel olacaktı ama şimdilik olsun bakalım.

Görünüşe bakılırsa zamanla sözlüğün yanına pek çok kardeş gelecek ve tabi ki hepsi birbirine tümleşik şekilde çalışacak, şimdiden kaydettirilmiş tek bir hesap yeterli olacak. Diğer uygulamaların ilk örneklerini belki yakında test edebileceksek bile kısa sürede kullanılabilir hale getiremeyeceğimden uzunca bir süre tek hizmet vermeye devam eden özelliğimiz sözlük olacak.

Ayrıca sözlüğün şu halinin de yetersiz olduğunun farkındayım. Bu sadece ilk sürüm.

Bir de beni tanıyanların bileceği gibi tasarım dediğimiz şeyden hiç anlamadığım gerçeği var ki bu sefer en azından acısız bir çözüm bulmanın keyfini çıkardım. Kısacası hiç bulaşmadım. Sitenin XHTML ve CSS’sini Cihan İnan hazırladı. Hatta renk seçiminde yardımcısı Samet Alboy oldu. Logomuzu ise Cihan’ın arkadaşlarından Yasemin Kuleli çizdi.

Tüm biyoloji ilgililerine hayırlı uğurlu olsun diyorum. Eleştirileri ve önerileri ne şekilde olursa olsun bekliyorum.

Bir süredir uğraştığım Django ile ilk işe yarar uygulamam hazır. Kitaplığındaki kitapları tehşir etmeyi ya da grupça web kütüphanesi oluşturmayı düşünenler için ideal. Google Code’da bulunan proje sayfasında özgürce kullanılmaya açık vaziyette. Fırsat buldukça proje wikisine yeni bilgiler eklemeyi de planlıyorum. Şuan yeterince açıklayıcı olmamış gibi gözüküyor. Orada yazdıklarımı tekrarlamak istemiyorum ama çok önemli olduğu için buraya da eklemeli. DreamHost üzerinde geliştirildi ve ayarlarla oynamadığınız sürece başka yerde çalışmaz. Sunucudan bağımsız çalışabilmesi için gerekli belgeleri ve kodları ekleyeceğimi tahmin ediyorum.

Ön yüzünün neye benzediğini görmek için http://kitaplar.serkan.gen.tr/ adresine bakabilirsiniz. Daha anlaşılabilir olması için hiçbir kısmında değişiklik yapmadan sadece bir kaç kitap ekledim. Tabi daha sonra bu adres benim kişisel kitaplığıma dönüşecektir ancak uzunca bir süre fırsat olmayacak.

Büyük yıl dönümüne iki gün kala gecikmiş bir uygulama olduğu kanısındayım.